陈友谅的格本就暴躁易怒，俘虏的报告迅速激怒了陈友谅，他打算用手的队去击打明军，陈友谅动用了十万人，并且指挥舰队向下游.行驶，他和他的舰队在1360年6月抵达太平。

1361年9月，朱元璋率军北上，他们先抵达安庆，俘获了一些船只，但没有破安庆城，于是接着北上。

接着是明军队伍中的浙江叛，因为朱元璋对南昌情况的一时疏忽，陈友谅取得时间来行重新武装，他预备接着攻摇摇坠的明政权。

陈友谅在九江署自己的军迎战，在朱元璋航行的途中，明军从两侧包围汉军阵线，陈友谅损失了一百多艘大小战船，但他自己避过朱元璋的耳目，溯江而上去了武昌。

陈友谅退缩武昌，徐达封锁陈友谅，这场封锁从1361年9月持续到1362年4月。

明将领云拒不投降，他率领三千明军在太平奋力抵抗了三天，陈友谅失去耐，用舰队中的大船去攻击太平城垣，最后云被俘，但拒绝顺降，牺牲于此战中。

朱元璋知明军远离南京，南京城有被张士诚的吴军攻的危险，但他认为他的队还是应该全力攻陈友谅的汉军。

陈友谅率领舰队直航南京，朱元璋已经获悉太平失陷的消息，但他的军与陈友谅无法较之下，有人提议放弃南京，转而守南京城东的紫金山。

由于当天暴雨天气，朱元璋又经过心设计，他和冯胜的军队攻汉军后卫，迅速赢了一仗。在南京这边战斗行的时候，胡大海从浙江犯江西，这个行动打开了明军在江西的战斗全景。

南京一仗之后，陈友谅因他的失败和给队带来的损失，他在江西的地位发生了动摇。

1361年10月底，南康、饶州、建昌派来使节拥护明政权，湖北东也有三个城池投降。

次日，明军在江面上攻击九江城垣，此刻陈友谅已经脱，朱元璋只好派徐达去追赶陈友谅。徐达没能赶上陈友谅，他在汉城外抛锚，于是徐达开始攻城，但依旧没有拿下汉。

1361年9月23日，明舰队到达鄱湖，湖。

1361年，朱元璋向长江上游军，他将陈友谅赶九江。但朱元璋在还没完全占领江西的时候就离开了南昌，南昌发生叛，朱元璋只能调回武昌的军队来镇压南昌的叛。

朱元璋在九江督阵，他采用政治攻势，迫使江西各个城池州府投降。

陈友谅得意洋洋，他预备以这战法横扫长江域。陈友谅将战舰停靠在采石码，他自己称帝，政权为‘汉’，并派遣使节去见张士诚，请他从背面兵，和自己一起前后夹击南京。

活动，又令徐达前往池州，与常遇汇合。明军两位将领联合伏击了偷袭者，活捉三千俘虏，并且常遇杀掉了大分人，还派了几个俘虏回去给陈友谅报信。

朱元璋决心迎战，他要诱陈友谅上岸，并引陈友谅去指定地，打伏击战。等陈友谅的师到了大胜关，这里港汊太窄，大船不能停靠，他又怕遇上埋伏，于是下令向长江返航。